中國是世界第一養(yǎng)豬大國，擁有全球最豐富的地方豬種資源。經(jīng)過近萬年的自然選擇和人工選育，中國地方豬種具有極佳的適應(yīng)性，可適應(yīng)中國南北方不同的生態(tài)環(huán)境。然而，導(dǎo)致這種環(huán)境適應(yīng)性的分子機理卻不為人知。
日前，江西農(nóng)業(yè)大學聯(lián)合深圳華大科技、美國加州大學伯克利分校的學者，在豬環(huán)境適應(yīng)性研究上取得重要進展，相關(guān)成果發(fā)布在《自然遺傳》上。
中國地方豬對全球現(xiàn)代商業(yè)豬種的培育作出過重要貢獻
此前，江西農(nóng)業(yè)大學豬遺傳改良與養(yǎng)殖技術(shù)國家重點實驗室歷時4年半，成功構(gòu)建了覆蓋我國24個省市自治區(qū)、現(xiàn)有68個豬種的中國地方豬種基因組dna庫。在此基礎(chǔ)上，研究人員挑選出15個不同地理居群的、代表廣泛血緣的12個豬種69頭無相關(guān)血緣的中國地方豬。
他們與深圳華大科技的研究人員一起，首次在豬中進行了全基因組高覆蓋度的重測序分析，由此鑒別了4100萬個基因組變異位點，其中52%為新發(fā)現(xiàn)的位點，該研究極大地豐富了國際豬基因組遺傳變異位點數(shù)據(jù)庫，證實了中國地方豬對全球現(xiàn)代商業(yè)豬種的培育作出過重要貢獻。
研究人員進一步采用群體基因組學研究策略，在全基因組范圍內(nèi)系統(tǒng)鑒別了與不同緯度環(huán)境適應(yīng)性有關(guān)的219個候選基因位點，揭示出中國南方豬和北方豬適應(yīng)不同溫度環(huán)境的分子機制。另外，研究人員在x號染色體發(fā)現(xiàn)一個長達14mb的低重組區(qū)，南北方豬在該區(qū)域存在兩種截然不同且經(jīng)歷了環(huán)境適應(yīng)性自然選擇的單倍型。
這是首次在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)古老屬間雜交導(dǎo)致適應(yīng)性進化的遺傳學證據(jù)，改變了人們對哺乳動物適應(yīng)性進化的認識。