誰(shuí)也不知道已在中國(guó)造成560多人感染、204人死亡的H7N9禽流感是否有可能進(jìn)化至可以很容易地在人群間傳播。而現(xiàn)在在家禽中針對(duì)H7N9開展的一項(xiàng)迄今最大規(guī)模的基因組調(diào)查提供了關(guān)于這一病毒進(jìn)化和傳播更為詳細(xì)的圖像。
H7N9首先是在2013年3月底在上海及周邊地區(qū)被發(fā)現(xiàn)，當(dāng)年的4月病例開始飆升。在確定活禽市場(chǎng)是疾病向人類傳播的主要途徑后初期的疫情很快得到了控制。盡管人們希望病毒能夠逐漸消失，但這一期望最終破滅，在那年的冬天H7N9再度歸來(lái)，向南方傳播造成了第二波大規(guī)模的人類感染。2014年的夏天暫時(shí)沒(méi)有出現(xiàn)新的病例，確證了它的季節(jié)性模式。而在去年年底感染又再度上升，這第三波感染至今仍在持續(xù)之中。
從多個(gè)省份活禽市場(chǎng)取得樣本
在發(fā)表于本周《自然》(Nature)雜志上的一篇論文中，由中國(guó)科學(xué)家們領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國(guó)際研究小組描述了從2013年10月到2014年7月，是如何通過(guò)從中國(guó)東部跨5省15個(gè)城市的活禽市場(chǎng)中取得家禽的拭子來(lái)追蹤這一病毒的。該研究檢測(cè)了平均7個(gè)城市活禽市場(chǎng)以及3%樣本中的H7N9病毒。
該研究小組測(cè)序了438個(gè)病毒株的基因組，發(fā)現(xiàn)隨著病毒向南方傳播，它演變?yōu)榱巳齻€(gè)主要分支，并具有多個(gè)次分支。
新發(fā)傳染性疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的病毒學(xué)家管軼(Yi Guan)以及深圳市第三人民醫(yī)院的朱華晨(Huachen Zhu)是這篇論文的共同通訊作者。
這樣的多樣化是在預(yù)期之中，追蹤它可以幫助鑒別出推動(dòng)病毒傳播的主要貿(mào)易路線及市場(chǎng)。管軼說(shuō)：“對(duì)于病毒在雞群中傳播程度還并不是很清楚，我們的論文證實(shí)這一病毒分化為了一些地方性的譜系。中國(guó)的東部仍然是這一病毒的儲(chǔ)存庫(kù)和‘分布中心’。”
管軼指出，隨著流感病毒在鳥類中進(jìn)化及多樣化，一些遺傳變化可以改變它們的傳染性、毒力或是在人群間傳播的能力。人類感染也為病毒提供了機(jī)會(huì)更好地適應(yīng)它們的宿主。
因此遺傳監(jiān)測(cè)對(duì)于追蹤突變，以及測(cè)試流感病毒株在哺乳動(dòng)物間例如雪貂和其他動(dòng)物模型中傳播的能力是否增高極為重要。從疫情爆發(fā)開始時(shí)，H7N9攜帶的一些突變使得它比H5N1禽流感能夠更容易地從鳥類傳播至人類。自2003年出現(xiàn)以來(lái)，H5N1已造成了16個(gè)國(guó)家784人感染，429人死亡。
缺乏監(jiān)測(cè)
當(dāng)前這一波的H7N9感染與研究小組追蹤的第二波感染可能具有不同的傳播模式。在這項(xiàng)最新的研究更新之前，2014年只收集了8個(gè)來(lái)自鳥類的基因組序列儲(chǔ)存在GenBank庫(kù)中，2013年只有258條序列。布魯塞爾自由大學(xué)禽流感流行病學(xué)家和生態(tài)學(xué)家Marius Gilbert說(shuō)，這不足以繪制出隨時(shí)間推移病毒的地理圖譜。
Nature新聞團(tuán)隊(duì)分析了在過(guò)去15年呈送至GenBank的所有禽流感亞型的測(cè)序基因組數(shù)量。結(jié)果顯示全球的整體遺傳檢測(cè)仍十分不利，不夠迅捷。大多數(shù)病毒都是在收集數(shù)月或數(shù)年后進(jìn)行測(cè)序。
管軼同意及時(shí)監(jiān)測(cè)非常重要。但監(jiān)測(cè)和病毒測(cè)試成本高昂且費(fèi)時(shí)——分離及測(cè)序病毒更是如此。這意味著難以在動(dòng)物群中常規(guī)監(jiān)測(cè)流感病毒，通常只是應(yīng)對(duì)疫情才會(huì)這樣做。對(duì)于H7N9來(lái)說(shuō)，測(cè)序病毒要求有權(quán)使用生物安全3級(jí)實(shí)驗(yàn)室。鑒于這些復(fù)雜因素，管軼認(rèn)為近期存儲(chǔ)在GenBank的H7N9序列數(shù)量已不算太少。
再加上時(shí)間滯后，進(jìn)行流感病毒株測(cè)序的公共機(jī)構(gòu)和研究人員有時(shí)只會(huì)在他們發(fā)表論文時(shí)才會(huì)將數(shù)據(jù)公諸于眾。新研究的作者們已將序列發(fā)送到了GenBank，此前也已與世界衛(wèi)生組織(WHO)和其他機(jī)構(gòu)分享了這些數(shù)據(jù)。
傳播風(fēng)險(xiǎn)
H7N9的威脅不大可能很快地消失。這一病毒現(xiàn)在正在整個(gè)中國(guó)地區(qū)的家禽中流行，有可能人們將繼續(xù)地發(fā)生零星感染。研究人員警告說(shuō)，“和從前的H5N1及H9N2流感病毒一樣，看起來(lái)家禽流動(dòng)通過(guò)跨境貿(mào)易將病毒傳播至中國(guó)之外的地區(qū)只是時(shí)間的問(wèn)題。”
管軼和他的合著者們說(shuō)，鑒于H7N9可以感染人類，應(yīng)該“將其視作為流行病毒出現(xiàn)的一個(gè)主要的候選者。”管軼指出鑒于流感病毒的數(shù)量龐大，有必要將疾病控制以及疫苗開發(fā)作為主要的目標(biāo)，并且H7N9應(yīng)該在列表的頂端。
目前的潛在威脅并不少。上個(gè)月WHO警告稱，當(dāng)前新動(dòng)物流感病毒的多樣性和地理分布是“前所未有的”——在世界各地出現(xiàn)了新病毒大雜燴，包括H10N8、H5N2、H5N3、H5N6和H5N8說(shuō)。有證據(jù)表明，不同的亞型當(dāng)前在更容易及快速地交換基因形成新的病毒株。管軼說(shuō)，要評(píng)估這些增加的多樣性是否代表了新出現(xiàn)大流行病毒有更大的威脅“幾乎是不可能的”。
（生物通）