由于農業(yè)作業(yè)方式的改變和農民生活水平的提高，一些農村地區(qū)不再將植物秸稈作為主要的生活燃料，而是將其付之一炬，一燒了之?，F在城市霧霾現象越來越嚴重，就和秸桿的燃燒有很大關系。
一、浪費生物資源：農作物秸稈是農業(yè)生產系統(tǒng)中一項寶貴的生物資源，也是保持生態(tài)平衡的重要物質基礎。據測定，每100kg農作物秸稈中含有機質15%以上，氮、磷、鉀營養(yǎng)元素含量分別是：小麥秸稈0.64、0.29、1.07，油菜秸稈0.656、0.344、2.109，水稻秸稈0.51、0.12、2.7，玉米秸稈0.61、0.21、2.28，并含一些中、微量元素。如果將1畝麥類秸稈直接還田，相當于增施55公斤有機質，15公斤碳銨、3公斤過磷酸鈣、7.5公斤硫酸鉀，可以增加土壤有機質含量，減少化肥用量、增強土壤的抗旱保水能力。如果將秸稈焚燒處理，造成大量有機質和氮、磷、鉀的丟失，據測定，焚燒后碳損失80%以上，氮損失70%，磷、鉀損失30%，且剩余的磷約25%轉化為緩效態(tài)或固定態(tài)。實踐證明，秸稈還田，可增加土壤有機質，提高耕地的綜合生產能力，減少化肥、農藥的施用量，減輕農業(yè)面源污染，提高抗御自然災害的能力。
二、破壞土壤生態(tài)平衡：
焚燒秸稈使土壤生態(tài)平衡受到破壞。土壤是由固體（無機體和有機體）、液體（土壤水分）和氣體（土壤空氣）組成的三相復合系統(tǒng)。每個組分都有自身的理化性質，相互間處于相對穩(wěn)定或變化狀態(tài)。每種土壤都有特定的微生物區(qū)系。小范圍內，土壤中的有機物質、養(yǎng)分、水熱資源處于一種平衡。秸稈焚燒破壞了這種平衡，主要表現在:一是燒死微生物。焚燒秸稈時產生溫度高達700℃，田間過火一遍，大量有益微生物被燒死、破壞了“土肥相融”，使腐殖質與礦質土粒緊密結合形成的有機無機復合膠體解體，把活土變?yōu)榱怂劳?；二是燒毀有機物，使秸稈中的炭、氮、木質纖維、樹脂等有機物質燃燒殆盡，只剩下一點灰分和無機元素，失去由秸稈還田增加土壤有機質帶來的種種益處；三是燃油殘留物污染土壤，機收后的麥秸，一般不能直接點火燃燒，很多農戶均向秸稈增灑燃油后，才進行焚燒，把燃油中的重金屬等有害物質直接或間接遺留在土壤中，造成對土壤的污染。
三、影響人民身體健康：野外焚燒秸稈，導致空氣中總懸浮顆粒數量明顯升高，對人們的健康造成嚴重危害。據測定，秸稈焚燒產生的煙霧中含有大量的CO、CO2、氮氧化物、光化學氧化劑和懸浮顆粒等物質，嚴重地段空氣中懸浮顆粒濃度是全年均值的7倍以上、CO2濃度是全年均值的9倍以上，這些物質被人體吸入或接觸后將會造成傷害。特別是在小春收獲期間，遇到冷空氣下降，空氣對流慢時，加之秸稈焚燒區(qū)域、時段均相對集中，在短時期內大量煙霧很難散盡，使得空氣中煙塵、顆粒物和其他污染物的濃度急劇增加，空氣質量迅速下降，使人們的呼吸道、眼科疾病發(fā)病率和復發(fā)率明顯提高，對中老年和兒童及患有呼吸道疾病的人影響最大，嚴重時會造成人畜窒息。